Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC9O60706 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms