Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGPSO00116 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGPSO00116 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGPSO00116 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGPSO00116 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGPSO00116 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGPSO00116 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGPSO00116 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGPSO00116 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms