Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms