Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 EIF3C-209ENST00000566501 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms