Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms