Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
C9orf92A6NGG3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
C9orf92A6NGG3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms