Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms