Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TARSL2A2RTX5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TARSL2A2RTX5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms