Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSEQ9UL01 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms