Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms