Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC180Q9P1Z9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms