Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms