Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms