Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms