Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PI4K2AQ9BTU6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PI4K2AQ9BTU6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms