Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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YIPF4Q9BSR8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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YIPF4Q9BSR8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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YIPF4Q9BSR8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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YIPF4Q9BSR8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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YIPF4Q9BSR8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
YIPF4Q9BSR8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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