Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NXNL1Q96CM4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms