Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms