Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA3Q8TBC4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms