Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms