Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms