Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC80Q76M96 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms