Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VSTM1Q6UX27 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms