Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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