Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms