Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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