Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms