Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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GABRA6Q16445 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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GABRA6Q16445 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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