Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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