Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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NEDD8Q15843 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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NEDD8Q15843 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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