Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR1D2Q14995 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms