Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms