Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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