Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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COL4A6Q14031 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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COL4A6Q14031 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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COL4A6Q14031 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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COL4A6Q14031 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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COL4A6Q14031 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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COL4A6Q14031 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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COL4A6Q14031 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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