Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PMS2P11Q13670 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PMS2P11Q13670 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PMS2P11Q13670 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PMS2P11Q13670 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PMS2P11Q13670 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PMS2P11Q13670 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PMS2P11Q13670 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PMS2P11Q13670 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PMS2P11Q13670 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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