Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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