Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms