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| FOXE3 | Q13461 | RPL23AP53-203 | ENST00000606975 | 736 nt | TSL 2 BASIC | 12.27 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PDCD6-212 | ENST00000614778 | 1050 nt | TSL 2 BASIC | 12.27 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RPP40-207 | ENST00000618533 | 1056 nt | TSL 5 BASIC | 12.27 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | C16orf54-201 | ENST00000329410 | 2585 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.27 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KRT35-201 | ENST00000246639 | 1778 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.27 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DSE-202 | ENST00000359564 | 4037 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.27 | □□□□□ -0.45 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | CYP4X1-201 | ENST00000371901 | 2357 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.27 | □□□□□ -0.45 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | LYAR-201 | ENST00000343470 | 1569 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | CUX1-211 | ENST00000546411 | 4212 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AL034550.2-201 | ENST00000620523 | 1771 nt | TSL 2 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | GFOD1-206 | ENST00000612338 | 2481 nt | TSL 2 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | STMN1-204 | ENST00000426559 | 948 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL845321.1-202 | ENST00000432011 | 786 nt | TSL 5 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HMGB2-203 | ENST00000446922 | 1175 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PRSS48-202 | ENST00000455694 | 989 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RN7SL399P-201 | ENST00000471648 | 279 nt | BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AL596325.1-201 | ENST00000563991 | 1082 nt | BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC004233.1-201 | ENST00000570515 | 608 nt | TSL 4 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | IFI27-213 | ENST00000620066 | 719 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC247036.4-201 | ENST00000632099 | 353 nt | APPRIS P1 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HS6ST2-201 | ENST00000370833 | 1938 nt | TSL 5 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC092198.1-201 | ENST00000447651 | 2691 nt | TSL 2 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | SPATS1-201 | ENST00000288390 | 1354 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | TMEM127-201 | ENST00000258439 | 6266 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GOLIM4-201 | ENST00000309027 | 2100 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NUMBL-201 | ENST00000252891 | 3561 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC007182.1-201 | ENST00000455232 | 2159 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | PDZD4-201 | ENST00000164640 | 3689 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SURF6-201 | ENST00000372022 | 4447 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HIST1H2AC-203 | ENST00000602637 | 1462 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ACE-203 | ENST00000413513 | 2237 nt | TSL 2 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC100803.3-201 | ENST00000606664 | 2961 nt | TSL 5 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PCDH19-202 | ENST00000373034 | 9756 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SCRN1-205 | ENST00000425819 | 1552 nt | TSL 2 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CFLAR-205 | ENST00000342795 | 1613 nt | TSL 5 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TNN-201 | ENST00000239462 | 5008 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AGFG1-202 | ENST00000373671 | 1669 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PRMT1-217 | ENST00000532489 | 1686 nt | TSL 5 BASIC | 12.26 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | R3HDM2-201 | ENST00000347140 | 4331 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ME2-201 | ENST00000321341 | 9415 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CDH7-203 | ENST00000536984 | 3766 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SRRT-217 | ENST00000618411 | 2893 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TSEN2-207 | ENST00000454502 | 1909 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CA10-201 | ENST00000285273 | 2914 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ARC-201 | ENST00000356613 | 2948 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NRP2-203 | ENST00000357785 | 2926 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MBD1-224 | ENST00000591416 | 4905 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GRM5-205 | ENST00000455756 | 7927 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AGPAT1-202 | ENST00000375104 | 2017 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ATG13-216 | ENST00000530500 | 2030 nt | TSL 2 BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PTPRO-202 | ENST00000348962 | 5061 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GNS-201 | ENST00000258145 | 5122 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ATG4B-206 | ENST00000405546 | 3294 nt | TSL 2 BASIC | 12.25 | □□□□□ -0.45 | | |