Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RPA4Q13156 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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