Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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