Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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EFEMP1Q12805 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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EFEMP1Q12805 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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