Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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