Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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