Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms