Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms