Protein–RNA interactions for Protein: Q09FC8

ZNF415, Zinc finger protein 415, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF415Q09FC8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF415Q09FC8 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF415Q09FC8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF415Q09FC8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms