Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms