Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms