Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms