Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms