Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TRA2BP62995 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TRA2BP62995 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRA2BP62995 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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